Andreas Pastoors ist seit 2015 als Privatdozent am Institut für Ur- und Frühgeschichte Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg tätig. In den Jahren 2017 und 2018 übernahm er die Professorale Vertretung des Lehrstuhls für Ältere Steinzeit am Institut für Ur- und Frühgeschichte an der Universität zu Köln. Pastoors ist zudem Administrator der internationalen Objektdatenbank NESPOS, in der alle wichtigen Daten rund um Neandertalerfunde und Fundstellen gespeichert werden.