Das Ende von Resafa wurde von dem Mongoleneinfall von 1247 eingeläutet, der den Handel und damit auch die Lebensgrundlage der Stadt weitestgehend zum Erliegen brachte. Ende des 13. Jhs. wird Resafa zum letzten mal in Schriftquellen erwähnt. Auf ein marginales Weiterleben in den Ruinen weisen geringe Bauspuren in der Folgezeit hin, u. a. eine notdürftige Moschee.
Von dem Mongoleneinfall zeugt möglicherweise ein einmaliger Versteckfund in einem am Rande des Hofs der Basilika A errichteten Gebäude. Hier fand sich ein Silberschatz aus mehreren Gefäßen, die wahrscheinlich die letzte liturgische Ausstattung der Kirche darstellten.Neben einer Schale, einer Patene und zwei Kelchen ist ein Wappenpokal besonders bemerkenswert. Man konnte diesen anhand seiner Wappen sogar einem Besitzer zuordnen, nämlich Raoul I., Sire de Couzy. Dieser Abkömmling einer französischen Adelsfamilie starb während des dritten Kreuzzugs 1191 in Akkon. Eine Weihinschrift auf dem Stück nennt aber eine Frau mit arabischem Namen, die den Pokal der Kirche des hl. Sergios gestiftet hat. Die Geschichte dieses Fundstücks ist symptomatisch für den Abstieg Resafas von einem Prunkstück des Morgenlandes über ein unbedeutendes Regionalzentrum zu einem Haufen vergessener Ruinen im Wüstensand.
An der Wiederentdeckung Resafas haben vor allem deutsche Archäologen ihren Anteil. Seit 1952 finden hier von ihnen geleitete Ausgrabungen statt, während denen die hier beschriebenen Gebäude erforscht wurden und so allmählich die ehemalige Bedeutung dieses Ortes wieder in das Bewußtsein geholt wurde.

S. Eismann